V přírodní vodě je často mnoho nečistot, z nichž hlavní, které ovlivňují kotel, jsou: suspendované látky, koloidní látky a rozpuštěné látky
1. Suspendované látky a běžné látky jsou složeny ze sedimentu, mrtvol zvířat a rostlin a některých nízkomolekulárních agregátů, které jsou hlavními faktory zakalení vody. Když se tyto nečistoty dostanou do iontoměniče, znečišťují iontoměnič a ovlivní kvalitu vody. Pokud se dostanou přímo do kotle, kvalita páry se snadno zhorší, hromadí se v bahně, ucpe potrubí a způsobí přehřátí kovu. Suspendované pevné látky a koloidní látky lze odstranit předúpravou
2. Rozpuštěné látky se týkají především solí a některých plynů rozpuštěných ve vodě. Přírodní voda, voda z vodovodu, která vypadá velmi čistě, také obsahuje různé rozpuštěné soli, včetně vápníku, hořčíku a soli. Tvrdé látky jsou hlavní příčinou zanášení kotle. Vzhledem k tomu, že vodní kámen je pro kotle velmi škodlivý, je odstranění tvrdosti a prevence vodního kamene primárním úkolem úpravy kotlové vody, čehož lze dosáhnout chemickou úpravou mimo kotel nebo chemickou úpravou uvnitř kotle.
3. Kyslík a oxid uhličitý působí především na zařízení topného plynového kotle v rozpuštěném plynu, které způsobují kyslíkovou korozi a korozi kotle kyselinou. Kyslíkové a vodíkové ionty jsou stále účinnější depolarizátory, které urychlují elektrochemickou korozi. Je to jeden z důležitých faktorů způsobujících korozi kotle. Rozpuštěný kyslík lze odstranit odvzdušňovačem nebo přidáním redukčních léků. V případě oxidu uhličitého může udržení určitého pH a zásaditosti vody v hrnci jeho účinek eliminovat.