U prirodnoj vodi često ima puno nečistoća, među kojima su glavne one koje utječu na kotao: suspendirane tvari, koloidne tvari i otopljene tvari
1. Suspendirane tvari i uobičajene tvari sastoje se od sedimenta, životinjskih i biljnih leševa i nekih niskomolekularnih agregata, koji su glavni čimbenici koji čine vodu zamućenom. Kada te nečistoće uđu u ionski izmjenjivač, zagadit će izmjenjivačku smolu i utjecati na kvalitetu vode. Ako uđu izravno u kotao, kvaliteta pare lako će se pogoršati, akumulirati u mulj, začepiti cijevi i uzrokovati pregrijavanje metala. Suspendirane krutine i koloidne tvari mogu se ukloniti prethodnom obradom
2. Otopljene tvari uglavnom se odnose na soli i neke plinove otopljene u vodi. Prirodna voda, voda iz slavine koja izgleda vrlo čista također sadrži razne otopljene soli, uključujući kalcij, magnezij i sol. Tvrde tvari su glavni uzrok zaprljanja kotla. Budući da je kamenac vrlo štetan za kotlove, uklanjanje tvrdoće i sprječavanje kamenca primarni je zadatak obrade kotlovske vode, što se može postići kemijskom obradom izvan kotla ili kemijskom obradom unutar kotla.
3. Kisik i ugljični dioksid uglavnom utječu na opremu kotlova za gorivo u otopljenom plinu, što uzrokuje koroziju kisikom i kiselinom u kotlu. Ioni kisika i vodika su ipak učinkovitiji depolarizatori, koji ubrzavaju elektrokemijsku koroziju. To je jedan od važnih čimbenika koji uzrokuju koroziju kotla. Otopljeni kisik može se ukloniti deaeratorom ili dodavanjem redukcijskih lijekova. U slučaju ugljičnog dioksida, održavanje određenog pH i lužnatosti vode u posudi može eliminirati njegov učinak.