לעתים קרובות יש הרבה זיהומים במים טבעיים, ביניהם העיקריים המשפיעים על הדוד הם: חומר מרחף, חומר קולואידי וחומר מומס
1. חומרים מרחפים וחומרים נפוצים מורכבים ממשקעים, גופות של בעלי חיים וצמחים, וכמה אגרגטים נמוכים מולקולריים, שהם הגורמים העיקריים שהופכים את המים לעכורים. כאשר זיהומים אלו ייכנסו אל מחליף היונים, הם יזהמו את שרף החליפין וישפיעו על איכות המים. אם הם נכנסים ישירות לדוד, איכות הקיטור תתדרדר בקלות, תצטבר לבוץ, תחסום את הצינורות ותגרום למתכת להתחמם יתר על המידה. ניתן להסיר מוצקים מרחפים וחומרים קולואידים על ידי טיפול מקדים
2. חומרים מומסים מתייחסים בעיקר למלחים ולחלק מהגזים המומסים במים. מים טבעיים, מי ברז שנראים טהורים מאוד מכילים גם מלחים מומסים שונים, ביניהם סידן, מגנזיום ומלח. חומרים קשים הם הגורם העיקרי לחיווי הדוד. מכיוון שאבנית מזיקה מאוד לדוודים, הסרת קשיות ומניעת אבנית היא המשימה העיקרית של טיפול במי הדוד, שניתן להשיג באמצעות טיפול כימי מחוץ לדוד או טיפול כימי בתוך הדוד
3. חמצן ופחמן דו חמצני משפיעים בעיקר על ציוד דודי גז הדלק בגז המומס, הגורמים לקורוזיית חמצן וקורוזיה חומצית לדוד. יוני חמצן ומימן הם עדיין מפילרים יעילים יותר, המאיצים את הקורוזיה האלקטרוכימית. זהו אחד הגורמים החשובים הגורמים לקורוזיה של הדוד. ניתן להסיר חמצן מומס על ידי מייבש או הוספת תרופות מפחיתות. במקרה של פחמן דו חמצני, שמירה על pH ובסיסיות מסוימת של מי הסיר יכולה לבטל את השפעתם.