Het proces van stoomsterilisatie bestaat uit verschillende stappen.
1. De stoomsterilisator is een gesloten container met een deur, en het laden van materialen moet de deur openen om te laden. De deur van de stoomsterilisator is bedoeld voor cleanrooms of situaties met biologische gevaren, om besmetting of secundaire vervuiling van items te voorkomen en het milieu
2 Voorverwarmen houdt in dat de sterilisatiekamer van de stoomsterilisator bedekt is met een stoommantel. Wanneer de stoomsterilisator wordt gestart, wordt de mantel gevuld met stoom om de sterilisatiekamer voor te verwarmen om stoom op te slaan. Dit helpt de tijd te verkorten die de stoomsterilisator nodig heeft om de vereiste temperatuur en druk te bereiken, vooral als de sterilisator opnieuw moet worden gebruikt of als de vloeistof moet worden gesteriliseerd.
3. Het uitlaat- en spoelcyclusproces van de sterilisator is de belangrijkste overweging bij het gebruik van stoom voor sterilisatie om lucht uit het systeem te verwijderen. Als er lucht aanwezig is, zal deze een thermische weerstand vormen, die de normale sterilisatie van de stoom naar de inhoud zal beïnvloeden. Sommige sterilisatoren laten expres wat lucht achter om de temperatuur te verlagen, in welk geval de sterilisatiecyclus langer zal duren.